Национальном парке большое разнобразие диких животных, по причине больших возможности для их обитание. Начиная с лесов до высоко горных лугов, вершин и ледников, до водоемов в незовиях и на окраинах населенных пунктов обитают розличные животные и птицы. В частности из парнокопитных млекопитающих сибирская косуля - (лат. Capreólus pygárgus),  марал - (лат. Cervus elaphus), дикая свиния, (лат. Sus scrofa). Из хишных млекопитающих Тянь-Шаньский бурый медведь (лат. Ursus arctos isabellinus), борсук (лат. Meles), каменная куница (лат. Martes foina), шакал (лат. Canis aureus), Туркестанская рысь (лат. Lynx Lynx isabellinus). Благодаря современным технологиям мы имеем возможности отслеживат и снимать их фото и видео на дебрях национального парка в естественом среде обитания.